Использование компьютеризированного анализа изображений в систематике грибов рода Fusarium

Актуальность проблемы: Fusarium — широко распространенный род грибов-микромицетов, включающий огромное число видов. Многие из них весьма вредоносны: вызывают болезни растений, а некоторые продуцируют микотоксины, являющиеся причиной отравлений сельскохозяйственных животных и человека. Многообразие видов Fusarium делают их идентификацию сложной задачей для специалистов по контролю качества пищевых продуктов, фитопатологов-консультантов и исследователей.

Классификация грибов рода Fusarium во многом основывается на характеристиках формы и размера макроконидий. Компьютеризированный анализ изображений позволяет количественно определить характерные морфологические особенности макроконидий, присущие каждому виду, что в свою очередь, является предпосылкой для их автоматической идентификации.

Материал исследований: макроконидии
Исследование выполнено с использованием программного обеспечения «ВидеоТесТ-Морфология» в лаборатории микологии ВНИИ Защиты растений, в.н.с., к.б.н. Гагкаевой Т.Ю. и с.н.с. , к.б.н. Ганнибалом Ф.Б. при содействии аспиранта кафедры Проектирования компьютерных систем СПбГУИТМО Прияткина Н.С.

Результаты автоматической классификации видов Fusarium

Классификация макроконидий: идентификация видов Fusarium осуществлена с помощью пользовательского классификатора. Использовались параметры, описывающие форму макроконидий: эквивалентный диаметр и округлость.